与很多新兴的现代金融技术的发展现状一样，区块链数字票据的发展尚处于探索阶段，仍存在不少问题有待研究和解决。这些问题，一部分与区块链技术自身的问题相关，另一部分是在应用过程中引起的。

区块链自身的问题运行高能耗问题在传统的货币银行学体系中存在“不可能三角”的辩证逻辑，在区块链构建的数字货币经济学体系中也存在相应的“不可能三角”问题(长铗，2014)，即不可能同时达到去中心化、低能耗和高度安全这三个要求，比如在比特币的实际应用中，其发展带来的结果是实现了计算机硬件的快速提升和膨胀，“挖矿”过程中的主要成本也转移到硬件成本和由之带来的电力成本等。所以，如何应用区块链技术实现权益成本收益，让其技术功效发挥至最大化将成为未来急需解决的重点问题之一。数据存储空间问题

利用区块链构建的系统需要记录从一开始发生的每一笔交易信息，并且参与进来的每个节点都要下载存储并实时更新数据区块，所以一旦每个参与节点的数据完全同步，一方面网络压力较大，另一方面每个参与节点的存储空间容量要求可能会成为制约其发展的关键问题。处理抗压能力问题基于区块链构建的系统遵循木桶理论，即永远要考虑所有网络节点中处理速度最慢和网络环境最差的那个，所以一旦将区块链技术推广至大规模交易环境下，其整体的抗压能力还没有得到实际的验证。

一旦每秒产生的交易量超过系统的设计容纳能力，或者超过最弱节点的容纳能力，那么交易就自动进入队列排队，如此会给使用者带来不良体验。例如，比特币的设定是每秒记录7笔交易，产生的数据区块大小为1M左右，但随着其加入者的增多，交易量提升，加之某个节点交互能力差、容纳力不足的可能性增大，整个比特币的网络已经严重超载，交易中有大量的交易在排队等待被打包成数据区块。在数字票据应用中的问题在传统的票据系统设计模式中，一旦提供标准化的开发接口，跨技术平台的系统对接和数据交互并不存在障碍。

但是，借助区块链构建的数字票据，每个节点都代表一个市场的参与方，自身也有相应的系统在运行，另外，在票据交易所的构造过程中，数字票据所在的联盟链还需要与其他技术平台下的系统或其他联盟链之间发生数据交互和功能调用等，产生了基于区块链构建的数字票据系统如何与其他平台下的系统对接的问题。借助区块链构建数字票据本质上是替代现有电子票据的构建方式，实现点对点的价值传递，但在整个社会没有公开发行和使用数字货币的前提下，如何实现数字票据与实物货币在资金清算中的实时对接将会是要面临的重要问题。比如在比特币交易所中，其最终的资金清算也是在线下进行的，通过现有的银行转账或者第三方支付实物货币的形式来体现。

在区块链构建的数字票据中，如果依旧采用线下实物货币资金清算的方式，那么其基于区块链能够产生的优势将大幅缩水，如果在其所在的联盟链中发行数字货币，那么数字货币的可编程性本身对数字票据就有了可替代性，可以把数字票据看作有承兑行、出票人、到期日、金额等要素的非标数字货币，两者之间存在一定的矛盾。从另外一个角度来看，借鉴现行电子票据模式中线上清算与备付金账户相挂钩的方式，实现数字票据的网络节点中与存有实物货币账户绑定的方式，也值得进一步研究。